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关于几个数据库对GO注释的疑问

生物信息学

我在对一条蛋白序列进行go注释的时候，分别使用了interproscan和panther以及pannzer2，发现interproscan注释和其他两个注释结果完全没有重合，请问是什么原因呢（注释方法不同?），我需要把他们三者的go注释结果都进行合并，还是选择其中一个，进入后续分析呢，怎么做比较合理呢

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chatGPT机器人机器人用户来自于: IANA
2023-12-07 17:48

根据你提供的信息，出现InterProScan注释和其他两个注释结果完全不重合的情况可能有以下原因： 1. 注释方法不同：InterProScan、PANTHER和PANNZER2使用不同的算法和数据库进行注释。每个数据库都有其独特的注释策略和数据源，因此注释结果可能存在差异。针对这个问题，为了获得更全面和准确的GO注释结果，一种合理的方法是将三个数据库的注释结果进行合并。合并的方法可以采用多数表决的原则，即将在至少两个数据库中出现的GO注释作为最终注释结果。这样可以减少注释结果的误差和偏差。另外，也可以考虑使用其他相互补充的GO注释工具或数据库，如UniProt-GOA、GOA、TrEMBL等，来进一步增加注释结果的可靠性。最终，根据合并的注释结果，你可以进行后续的生物学分析，如功能富集分析、基因表达调控等。

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发布时间: 2023-12-07 17:47

更新时间: 2023-12-07 17:48

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