2
关注
3909
浏览

请问hisat2+stringtie+deseq2的标准流程

查看全部 2 个回答

孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2023-08-15 17:13

如果你是注释非常好的物种,比如人,小鼠之类的,可以不用搞stringtie流程,这个是组装参考转录组用的。

如果你用的是注释不那么完善的物种,那么建议根据自己的数据跑一下stringtie,拼一下转录本。

关于作者

问题动态

发布时间
2023-07-31 10:34
更新时间
2023-08-15 17:13
关注人数
2 人关注

推荐内容

聚类数据标准化
基因表达
ciriRNA表达量如何计算?
log2(fold_change)可以用来做热图吗?遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为0时,怎么办?
链特异性文库(mRNA/lncRNA/circRNA)如何将RNA类型分开?
无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因
为什么差异基因分析会出现被KO的基因log2FC的数值大于1的情况
转录组测序问题
肿瘤亚型分析
转录组和代谢组联合分析的方法有那些?
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2026