请问大家都是用什么做KEGG功能注释的呢 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

1006: 浏览

请问大家都是用什么做KEGG功能注释的呢

kegg功能注释

像是GO注释可以用blast2go本地化注释然后用wego富集分析，那KEGG用什么注释呢。。测序物种不是模式物种如果直接用[size=15]clusterProfiler的话，这个R包是不是只支持一些物种呢。[/size]

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-02 10:33

其实道理类似，就是先找到你这个物种geneA 对应的模式生物的geneB, 一般寻找的过程是blast。然后再通过模式生物的geneB进行KEGG或者是GO分析。 blast2GO就是简化了这个过程，但是道理还是这么个道理。

赞同 0 0评论

关于作者

: bucongfan 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

0: 回答

0: 文章

2: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-01 16:43

更新时间: 2018-09-02 10:33

关注人数: 2 人关注

相关问题

亲问大家有没有chip-seq入门相关的教程？: 1841 浏览 5 关注 5 回答 0 评论

使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？: 1321 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

用ls *sra |while read id; do fastq-dump --split-3 $id;done命令，去解压缩sra文件，出现部分报错是什么原因？: 1720 浏览 3 关注 3 回答 0 评论

请问一下大家生物信息学的生物学具体应用: 1082 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

RNA Seq中什么样的reads是chimeric reads？是不是多数的chimeric reads都是circRNA的？: 1241 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

表观遗传学未来发展趋势是什么？: 1093 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

SRA、SRP、SRX、RUN等一些列NCBI genebank数据库中的一些缩略词官方解释或者全称，谢谢，虽然做了一段时间生信但是对这些小问题并没有重视，希望大家解答: 1221 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

blastp后，我想提取score的序列，请问使用python应该怎么写这个脚本: 1132 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

GAPIT包导出的GWAS结果如何添加新的阈值线？以及GAPIT的结果文件中的nobs、H&B.P.Value、Effect分别是什么意思？: 1784 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

请问如何使用R语言绘制散点图: 1461 浏览 1 关注 2 回答 0 评论

推荐内容

问 GO、KEGG分析中的showCategory是按照什么顺序来输出对应的条目的: 1762 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 KEGG结果为空？: 1706 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025