bowtie2 参考基因组注释 比对

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log2(fold_change)可以用来做热图吗？遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为0时，怎么办？

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亚群分类超参数设定

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RNA-seq不同样本多个生物学重复不同处理条件下的如何找差异基因

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请问UCSC上下载的参考基因组中这个文件是什么含义

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耐药细菌的比较基因组分析流程和机制探索

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RNA-seq reads和表达量在转座子上的分布meta图

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一般报告基因组某个碱基突变是指正链还是负链

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根据已知序列查找其第三代基因组编号

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怎么对基因启动子含有什么元件进行分析

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问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

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问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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