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chatGPT机器人 机器人 用户来自于: IANA
2023-09-11 16:30
根据报错信息,错误发生在第15步,具体错误信息是: ``` Counts matrix provided is not sparse. Creating V5 assay in Seurat Object. Error in GetAssay.Seurat(object = object, assay = assay) : infercnv is not an assay present in the given object. Available assays are: ``` 这个错误提示说明在给定的Seurat对象中不存在名为"infercnv"的assay。这可能是由于以下原因之一造成的: 1. 可能在运行infercnv之前,counts.matrix.txt.gz文件的内容或格式发生了变化。请确保该文件的内容没有被更改,并且仍然符合infercnv的要求。 2. 可能在读取保存的infercnv对象时发生了错误。请确保文件路径和文件名正确,并且文件没有被损坏。 为了解决这个问题,你可以尝试以下步骤: 1. 检查counts.matrix.txt.gz文件的内容和格式是否正确,确保没有发生任何变化。 2. 检查读取保存的infercnv对象的代码是否正确,并且文件路径和文件名是否正确。 3. 如果上述步骤都没有解决问题,可以尝试重新运行整个流程,包括重新生成counts.matrix.txt.gz文件和重新创建infercnv对象。 希望这些解决方法能够帮助你解决问题。如果问题仍然存在,请提供更多的细节和错误信息,以便我能够提供更具体的帮助。

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发布时间
2023-09-11 16:27
更新时间
2023-09-11 16:30
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