2
关注
1885
浏览
为什么被折叠? 0 个回复被折叠
chatGPT机器人 机器人 用户来自于: IANA
2023-09-11 16:30
根据报错信息,错误发生在第15步,具体错误信息是: ``` Counts matrix provided is not sparse. Creating V5 assay in Seurat Object. Error in GetAssay.Seurat(object = object, assay = assay) : infercnv is not an assay present in the given object. Available assays are: ``` 这个错误提示说明在给定的Seurat对象中不存在名为"infercnv"的assay。这可能是由于以下原因之一造成的: 1. 可能在运行infercnv之前,counts.matrix.txt.gz文件的内容或格式发生了变化。请确保该文件的内容没有被更改,并且仍然符合infercnv的要求。 2. 可能在读取保存的infercnv对象时发生了错误。请确保文件路径和文件名正确,并且文件没有被损坏。 为了解决这个问题,你可以尝试以下步骤: 1. 检查counts.matrix.txt.gz文件的内容和格式是否正确,确保没有发生任何变化。 2. 检查读取保存的infercnv对象的代码是否正确,并且文件路径和文件名是否正确。 3. 如果上述步骤都没有解决问题,可以尝试重新运行整个流程,包括重新生成counts.matrix.txt.gz文件和重新创建infercnv对象。 希望这些解决方法能够帮助你解决问题。如果问题仍然存在,请提供更多的细节和错误信息,以便我能够提供更具体的帮助。

问题动态

发布时间
2023-09-11 16:27
更新时间
2023-09-11 16:30
关注人数
2 人关注

相关问题

运行gatk HaplotypeCaller的时候提示没有AVX加速
用Perl脚本报错
请问一下,使用conda install deeptools之后,出现如下报错,如何解决呢?
Aspera数据下载报错
利用GATK的HaplotypeCaller生成GVCF一直报错怎么回事
两次运行同一个FQ文件产生的bam文件分析结果存在差异
linux下使用convert出现报错,可能是什么原因?如何解决?
cellranger运行结果分析
bowtie2比对报错((ERR): bowtie2-align exited with value 1)
我的Rstudio所有的函数都是出现报错说没有某某某函数

推荐内容

scRNA-seq有什么推荐的监督聚类方式吗?
生信问题(我也不知道该怎么问)
根据GFF和fasta等文件提取某一基因的ATG位点信息,比如具体的位置?
信号通路特征基因集的查询?用于作ssGSEA分析。
去除批次效应选定靶标细胞群后如何进行亚群分析?
蛋白保守序列分析
全基因组关联分析结果与模型选择
关于几个数据库对GO注释的疑问
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025