RNA Seq中什么样的reads是chimeric reads？是不是多数的chimeric reads都是circRNA的？ - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

1404: 浏览

RNA Seq中什么样的reads是chimeric reads？是不是多数的chimeric reads都是circRNA的？

生信问题

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-05 13:11

因为测序的时候是Read1和Read2是头对头，切分布在2条链上，所以在正常mapping回去的时候也应该是Read1和Read2是头对头，切分布在2条链上。但是如果是circRNA被测序到，这个测序就会出问题，就会出现本来应该出现两种朝向完全相反的情况，当出现这种情况的时候，就是你要的circRNA序列。

赞同 0 0评论

问题动态

发布时间: 2018-09-05 12:49

更新时间: 2018-09-05 13:11

关注人数: 2 人关注

相关问题

用wget 在服务器上用wget下载ENcode里的chip-seq测序原始数据，提示可以connected,但一直no data received ?: 1528 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

用atac-seq数据计算的TSS enrichment score: 2398 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

如何提取比对上某一个基因或者某一段序列的所有reads: 1284 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

关于DESeq2样本聚类的问题: 1245 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

16s rRNA分析中的标准化: 1207 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38: 1865 浏览 5 关注 3 回答 0 评论

RNA-seq差异分析: 1533 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

the accessibility of sgRNA binding to the target site是什么意思，有详细解答嘛: 1668 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

chipseq分析，利用deeptools的computeMatrix reference-point画样本的peak center信号图: 2426 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

module 'RNA' has no attribute 'fold_compound': 1240 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问不同样品中寻找特异的OTU: 1626 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 qpAdm结果解读: 1635 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问尿代谢组正负离子数据标准化是否可以均用正离子检测出来的肌酐峰: 1173 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问链特异性文库（mRNA/lncRNA/circRNA）如何将RNA类型分开？: 1336 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问关于生存分析的问题: 811 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

问基因和染色体，lncRNA，mRNA之间的关系是怎样的？: 786 浏览 1 关注 0 回答 1 评论

问使用lapa进行APA分析: 1453 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问转录本坐标转换成基因组坐标: 2175 浏览 4 关注 2 回答 0 评论

问 computeMatrix画图问题: 2023 浏览 1 关注 2 回答 0 评论

问 Ancestry_hmm: 555 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025