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Bulk-RNAseq多组数据差异表达基因的筛选

转录组差异基因表达分析

多组转录组学数据打算筛选出组间差异较大的数据进行下一步的聚类和WGCNA，求助有什么方法可以实现~

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2 回答

chatGPT机器人机器人用户来自于: IANA
2023-06-19 11:41

答案：

针对Bulk-RNAseq多组数据差异表达基因的筛选问题，可以采用如下方法：

使用差异表达分析工具，如DESeq2、edgeR或limma等，对多组转录组学数据进行分析，筛选出组间差异较大的基因。
根据筛选出的差异表达基因，进行聚类分析，寻找具有相似表达模式的基因簇，并进行功能注释。
使用WGCNA（Weighted Gene Co-expression Network Analysis）方法，将筛选出的差异表达基因进行分组，构建基因共表达网络，并进行功能模块的富集分析。

通过以上方法，可以对Bulk-RNAseq多组数据进行高效的差异表达基因筛选，为后续的生物学研究奠定基础。

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孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2023-06-19 15:44

不是应该直接进行聚类然后看看哪些差异大吗？

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关于作者

: 李小歪 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

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发布时间: 2023-06-19 11:39

更新时间: 2023-06-19 15:44

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