SRR1924430的sra数据与hdf5提取的fastq不一致 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

1: 关注

573: 浏览

SRR1924430的sra数据与hdf5提取的fastq不一致

数据处理

从SRA下载了SRR194430.sra文件，fastq-dump转为fastq时，出现如下情况 [attach]267[/attach] 不知其因，所以又从EBI下载了SRR1924430的fastq文件，结果，emmm，EBI的fastq文件就是sra转了一部分的那个fastq文件。两个文件都是1030条reads。然后下载的SRR1924430_hdf5.tgz解压后，使用工具pbh5tools参数ccs提取fastq，emmm，reads数量：1025条。所以，问题1：为什么会出现如图所示的情况（没有输出的reads是什么，为什么不输出）？问题2：为什么从hdf5文件中提取的reads数量与下载的fastq中reads数量不一致?

好问题 0 评论收藏举报

0 回答

暂无回答

关于作者

: xsp 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

2: 回答

0: 文章

4: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-25 17:19

更新时间: 2018-09-25 17:19

关注人数: 1 人关注

相关问题

为什么单端测序的数据解压会出现多个文件？: 926 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

奇异值分解在处理芯片数据时的意义是什么？: 714 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

转录组数据样本聚类结果不理想: 816 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

GEO数据读入: 614 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

axel，wget下载数据出错的问题，没头绪: 965 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

Aspera数据下载报错: 1403 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

TCGA数据下载: 734 浏览 2 关注 1 回答 2 评论

对于BLAST算法在高歌老师的课上提到运用哈希函数和有限自动机的模型去提高数据检索效率，不是很理解其中的原理，希望得到大神们的帮助: 1064 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

公司双端测序的数据R1R2处理: 1068 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如何对特征数量少的空间蛋白组数据进行细胞聚类？: 1409 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问 aspera SRA 数据批量下载: 1155 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 Homer预测motif: 711 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 bowtie2 参考基因组注释比对: 1123 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 WES数据下游分析和可视化结果展示: 1490 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 TWAS联合PWAS做 conditional analysis: 777 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 linux bam数据替换: 1161 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问如何获得cas9蛋白的高效低效的sgRNA: 791 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问验证数据集基因名称: 658 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 Chip-seq bam文件的处理: 1552 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024