芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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已经有不同材料的全基因组二代测序数据，查找是否存在某个已知基因？

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知道一批基因的具体位置，如何批量的从基因组中取出基因序列？

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基因组组装问题

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无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因

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基因表达

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关于基因间的相关性分析

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获取所有基因的转录起始位点（TSS）

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关于hub基因的问题

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如何根据Datamonkey中FUBAR的结果计算该基因的dn/ds值

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问 原核生物的转录组测序为什么比真核的贵？

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问 请问hisat2+stringtie+deseq2的标准流程

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问 菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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问 如何根据转录组数据得到新转录本？如何验证一个基因的多个转录本？

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问 转录组和代谢组联合分析的方法有那些？

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问 链特异性文库（mRNA/lncRNA/circRNA）如何将RNA类型分开？

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问 用log2(fold_change)数据做热图，遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为inf或-inf时，怎么办？

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问 几个酶有许多共同基因，这些酶产物之间存在什么关系

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问 进行转录组数据分析时，进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中，一个基因出现了两个不同的表达量数据，应该如何处理？

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问 ciriRNA表达量如何计算？

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