进行转录组数据分析时，进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中，一个基因出现了两个不同的表达量数据，应该如何处理？

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测了实验组与对照组的mRNA与miRNA的转录组，miRNA-mRNA互作分析网络怎么处理呢？

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WGCNA筛选到感兴趣的模块后，如何找这个模块的hub基因呢？

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关于tophat2 + cufflinks 得到的差异基因和featureCounts差异基因数目相差太大原因

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关于hub基因的问题

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如果在基因组中鉴定到病毒序列，如何从生信角度判断它是EVEs还是HGTs

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为什么差异基因分析会出现被KO的基因log2FC的数值大于1的情况

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怎么寻找某个基因的不同可变剪切形式？

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怎么准确提取某一基因的ATG起始密码子位点

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关于 截取某基因前后200bp片段

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问 WGCNA

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问 无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因

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问 请问hisat2+stringtie+deseq2的标准流程

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问 链特异性文库（mRNA/lncRNA/circRNA）如何将RNA类型分开？

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问 转录组测序问题

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问 ciriRNA表达量如何计算？

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问 转录组和代谢组联合分析的方法有那些？

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问 用log2(fold_change)数据做热图，遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为inf或-inf时，怎么办？

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问 我测了一批寄生蜂的转录组样品，FPKM值感觉好奇怪，合理吗？

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问 菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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