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怎么寻找某个基因的不同可变剪切形式？

可变剪切

如题，想寻找EZH2这个基因在患者中的可变剪切形式和对应的表达丰度，不知道用什么软件怎么看呢

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孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-15 19:31

不同剪切形式，可以用UCSC genome browser去看，比如你说的这个gene [attach]220[/attach] 里面每一行就是1个转录本，就是不同的isoform。至于isoform的定量，现在都不准。你可以用cuffdiff或者stringtie那一套碰碰运气。

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ChaozhongLiu 初级会员用户来自于: 美国
2018-09-15 02:22

我记得cufflinks配合cummeRbund可以做到

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关于作者

: mrfoolish 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

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发布时间: 2018-09-14 11:55

更新时间: 2023-05-17 18:26

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