【求助】如何确定一种基因ID的类型 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

4: 关注

3523: 浏览

【求助】如何确定一种基因ID的类型

例如：有三种不同类型的基因ID用于描述玉米的某些基因，如何用R知道，这是属于什么类型的（symbol、ensemble...） 1. Zm00001d035139 Zm00001d025707 Zm00001d046812 Zm00001d031303 2. NR_028022.2 NR_036655.1 NM_001149456.1 XM_008650099.1 3. GRMZM2G010044 GRMZM2G175593 GRMZM2G468111 GRMZM2G152179 GRMZM2G006352 GRMZM2G133988

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 2 个回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-08-24 00:08

这个没有太好的办法，就是凭经验。比如你写的，第一种就特别像玉米的gene id，第二种就是RefSeq，第三种不清楚。我觉得这不是一个特别费心思的事情，首先做一个方向，常见的几种形式需要知道和熟悉，比如ensembl，比如refseq，比如ucsc。其次，看到不熟悉的gene id形式直接就google，然后找到对应命名网站学习命名规则就好。如果非要给个解决方案，可以试试DAVID，里面可以猜你的id是哪种类型。

赞同 2 0评论

关于作者

: 徐寅生 初级会员
这家伙很懒，还没有设置简介

1: 回答

0: 文章

10: 问题

问题动态

发布时间: 2018-08-23 22:40

更新时间: 2018-08-24 00:32

关注人数: 4 人关注

相关问题

多种DL based的label transfer自动注释细胞类型,降维clustering两者不太匹配. 如何进行下一步的paga analysis呢?: 2688 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

请问一下，如何将登陆服务器局域网的ip设置为静态的呢？: 1763 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

人源细胞系ATAC-seq比对率较低，显示支原体污染，如何处理？: 3008 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

求助GATK 说明书: 1428 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

二代测序得到测序数据组装完成后如何进行丰度计算: 2427 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

tsRNA测序思路求助: 2728 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

通过富集得到了一些信号通路，我想看看这些通路里哪些是和癌症相关的，如何实现呢？: 3083 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

如何批量绘制多条折线: 2742 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

有台Dell工作站，如何配置成服务器: 2292 浏览 4 关注 2 回答 0 评论

如何对新建网站进行暴力测试？: 6886 浏览 8 关注 11 回答 0 评论

推荐内容

问我想从蠕虫库寄生虫 (wormbase.org)上下载全部的fa文件，请问怎么样才能批量的下载，同时下载的速度可以稍微快一点: 3031 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

问链特异性文库（mRNA/lncRNA/circRNA）如何将RNA类型分开？: 2178 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 tophat报错 & cufflinks安装报错: 1801 浏览 2 关注 0 回答 0 评论

问不同测序平台的scRNAseq数据集整合（10✖️、smart-seq）: 2440 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 xpclr的XPCLR_score的inf值应该怎么处理: 2644 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问安装anaconda时conda命令无法起作用: 3569 浏览 5 关注 5 回答 0 评论

问【求助】如何确定时期特定表达基因: 1883 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 fastsimcoal群体历史动态模拟bootstrap时的maxL.par文件设置: 2944 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 logistic回归、异常值: 2240 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025