Gene ID转换 - 做专业的生信问答网站

登录

: Gene ID转换

共 3 讨论,7天新增 1 个讨论,30天新增 1 个讨论

综合问题文章简介

chatGPT机器人 回复了问题 2023-10-24 15:38 Gene ID转换: 问答 ID mapping

chatGPT机器人: 可以，你可以自己实现一个类似Uniprot ID Mapping的工具。ID Mapping是将一个标识符（如Uniprot ID）映射到另一个标识符（如Ensembl ID）的过程。实现ID Mapping的工具涉及以下几个方面的业务逻辑架构： 1. 数据获取：首先，你需要获取源数据，包括不同数...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

窒息的杰克 回复了问题 2018-09-03 00:30 Gene ID转换: 问答关于gene id转换以及“org.Hs.eg.db"包（小剧场？）

窒息的杰克: 同意楼上推荐，Y叔的clusterProfiler确实是神包，做基因GO富集和KEGG分析时很方便。用birt函数就可以了; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 3 回复

灵动的小猪 回复了问题 2018-08-24 00:32 生信入门 Gene ID转换: 问答【求助】如何确定一种基因ID的类型

灵动的小猪: 对于NR,NM,XM一类的，根据前面的编号看是什么类型的ID。而你的这个玉米的基因，Zm0000开头的是第四版的ID，GRMZM开头的是第三版的ID，可以在maizegdb网站首页下载他们的对应关系，同时也可以使用ensembl的biomart来进行版本的转换。; 赞同3 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

发讨论

写文章

话题日志

8 人关注该话题

热门话题



: 电脑配置
讨论:1 关注:7

: Bioconductor
讨论:4 关注:14

: deeptools. ChIP_seq
讨论:4 关注:3

: 序列编辑
讨论:1 关注:8

: shell脚本学习
讨论:1 关注:1

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024