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使用cutadapt去掉adaptor后,fastqc结果的sequence distribution报错

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孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2018-08-23 17:21
是这样,因为每个reads真正测出来的adapter的长度是不同的,因此去掉adapter以后剩下的序列长度也就不同了。 FastQC这个软件,当你的reads长度范围超过一定的时候都会报错,问题不大。   如果想要弄成长度一样的序列,可以考虑使用[size=14]fastx_trimmer 或者是seqkit里面的工具trim成一样长。[/size]

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发布时间
2018-08-23 16:59
更新时间
2018-08-23 17:21
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