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使用cutadapt去掉adaptor后,fastqc结果的sequence distribution报错
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使用cutadapt去掉adaptor后,fastqc结果的sequence distribution报错
问题求解
FASTQC
原始数据文件先进行了fastqc,发现有adaptor未去除,使用cutadapt软件进行去除后,重新fastqc,结果发现adaptor去掉了,但是sequence disribution报错,不知道为啥,还请大家帮忙看看问题出在哪里? cutadapt命令如下: cutadapt -a CTGTCTCTTATA -q 30 -m 20 --trim-n -O 10 -o B3.fastq.gz B3-S.fastq.gz
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Kevin_Lyu
前台管理员
用户来自于: 福建省福州市
2018-08-23 17:06
切完接头以后,reads长度出现差异了,可以用fastx_trimmer把reads修齐
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windowft
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这家伙很懒,还没有设置简介
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发布时间
2018-08-23 16:59
更新时间
2018-08-23 17:21
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