首页
问答
文章
专栏
大咖
更多
话题
帮助
请输入关键字进行搜索
查看更多 "
" 的搜索结果
登录
单细胞RNA-seq,如何计算不同cluster之间的相关性
关注问题
回答问题
该问题已被锁定!
2
关注
2075
浏览
单细胞RNA-seq,如何计算不同cluster之间的相关性
单细胞RNA_seq
该图描述的是单细胞RNA-seq中20个cluster之间的相关性比较,如果我用R中的cor函数计算相关性,我只能得到所有细胞之间两两比较的相关性。那么采用哪种评估标准,可以用一个值或一个向量代表一个cluster的身份,并得到图中这种cluster与cluster之间的相关性呢? [attach]248[/attach]
阅读全文
收起全文
关注问题
回答问题
邀请回答
好问题
0
评论
收藏
举报
分享
复制链接
新浪微博
腾讯空间
微信扫一扫
展开
收起
0
评论
查看全部
1
个回答
孟浩巍
超级管理员
用户来自于: 北京市
2018-09-20 21:55
你可以去看一下paper里是怎么计算的,无外乎就是这么几个思路: 1. 选择cluster细胞中的平均情况,然后计算; 2. 选择cluster细胞中的代表情况,然后计算; 3. 选择cluster细胞中的一些特征信息,然后计算;
阅读全文
收起全文
赞同
0
2
评论
分享
复制链接
新浪微博
腾讯空间
微信扫一扫
2
评论
关于作者
杨麻麻
注册会员
这家伙很懒,还没有设置简介
0
回答
0
文章
1
问题
问题动态
发布时间
2018-09-20 21:05
更新时间
2018-09-20 21:55
关注人数
2 人关注
相关问题
请问一下,如何将登陆服务器局域网的ip设置为静态的呢?
1406 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
如何在西宁附近旅游三天
1532 浏览
3 关注
2 回答
0 评论
RNA-seq比对region:exonic/intronic/intergenic 比例异常
2531 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
二代测序得到测序数据组装完成后如何进行丰度计算
2055 浏览
1 关注
1 回答
0 评论
x <- x[keep.exprs,, keep.lib.sizes=FALSE] 请问一下这条命令该如何解读呢?
1154 浏览
1 关注
0 回答
2 评论
RNA-seq count值和fpkm值不对应
3001 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
去除批次效应选定靶标细胞群后如何进行亚群分析?
2790 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
通过富集得到了一些信号通路,我想看看这些通路里哪些是和癌症相关的,如何实现呢?
2537 浏览
4 关注
3 回答
0 评论
ciriRNA表达量如何计算?
2329 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
如何使用seqtk按照比例随机提取单细胞数据?
2548 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
推荐内容
问
单细胞——小鼠T细胞注释的markers
3058 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
问
关于scrublet的使用
2924 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
使用seurat包,导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。出现问题
2837 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
你好chatGPT,可以提供包含双细胞去除的单细胞分析完整流程吗?
2398 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
问
singularity查到不到指定输入文件位置
2340 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
celseq2转换单细胞原始数据
2171 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
问
infercnv运行报错
3780 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
问
整合scRNA和scATAC相关问题请教
2653 浏览
2 关注
3 回答
0 评论
问
harmony整合样本前需要分别预处理吗?
2412 浏览
2 关注
2 回答
0 评论
问
seurat中如何通过坐标/细胞名删掉细胞
4050 浏览
2 关注
1 回答
0 评论
All Rights Reserved Powered BY
WeCenter V4.1.0
© 2025
关于我们
社区规范
你的浏览器版本过低,可能导致网站部分内容不能正常使用!
为了能正常使用网站功能,请使用以下浏览器
Chrome
Firefox
Safari
IE 10+