使用bedtools提取序列时的deyond length问题；bed负值

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在N-W算法中，为什么忽略了从x状态道y状态的转化（xi对应到一个空位到yi对应一个空位的转化）

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为什么用prokka注释完，都是假设蛋白质

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关于scrublet的使用

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使用deeptools生成ChIP-seq信号热图与谱图

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为什么我的R count用不了呢？

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网上下载的DNA sequence 为什么前面和后面有一段N是什么意思？

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使用tophat2和bowtie1寻找环形RNA时报错

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为什么单端测序的数据解压会出现多个文件？

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Liux中gtftk closest_genes怎么使用？

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问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

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问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

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问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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问 基因表达芯片的分类问题

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问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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