如何在差异表达前消除批次效应

798 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

请问如何查询某基因的详细的Biological Function？

689 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如何快速将基因名称转换为基因ID(拟南芥）

684 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

de novo mutation检测和判断

542 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如何知道自己测序的adapter序列？

963 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

请问有谁知道这张图是如何绘制的吗，在NCBI的Conserved Domians模块没找到可以直接导出的地方

722 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

用scanpy做单细胞分析，如何去除周期细胞的影响

930 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

如何批量下载SRA数据库中的数据？

998 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

3D基因组里，如何分清compartment、TAD和chromatin loop

1085 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

人源细胞系ATAC-seq比对率较低，显示支原体污染，如何处理？

809 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

804 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

701 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 基因表达芯片的分类问题

884 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

925 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

452 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

586 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

640 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

895 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

965 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

1043 浏览 2 关注 3 回答 0 评论