如何从NCBI上分别下载所有的RNA病毒和DNA病毒的序列

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如何对特征数量少的空间蛋白组数据进行细胞聚类？

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VCONTACT2的结果文件genome_by_genome_overview如何进行统计分类

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如果在基因组中鉴定到病毒序列，如何从生信角度判断它是EVEs还是HGTs

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无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因

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如何筛选小鼠lncRNA?

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二代测序得到测序数据组装完成后如何进行丰度计算

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通过富集得到了一些信号通路，我想看看这些通路里哪些是和癌症相关的，如何实现呢？

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如何根据Datamonkey中FUBAR的结果计算该基因的dn/ds值

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请问如何查询某基因的详细的Biological Function？

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问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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