该问题已被锁定!
2
关注
1474
浏览

来自不同project的RNA-Seq数据可以直接合并分析吗?

为什么被折叠? 0 个回复被折叠
孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2018-10-12 17:27
不建议合并,因为还是有batch的因素的。 关于batch effect的内容,我倒是建议你直接读读DESeq2和cuffdiff的原始paper,因为他们在写这个软件的时候,专门考虑过这个问题。

关于作者

tzjzzrz 注册会员

这家伙很懒,还没有设置简介

问题动态

发布时间
2018-10-11 00:01
更新时间
2018-10-12 17:27
关注人数
2 人关注

相关问题

不同测序平台的scRNAseq数据集整合(10✖️、smart-seq)
RNA-seq分析,rlog需要生物学重复才行?有别的Normalization方法吗?
rna-seq数据校正
RNA-seq比对region:exonic/intronic/intergenic 比例异常
不同样品中寻找特异的OTU
怎么寻找某个基因的不同可变剪切形式?
RNA-seq count值和fpkm值不对应
请问RNA-seq采用poly A(+)策略建库,处理数据时若不去除rRNA会对后续分析有何影响?
单细胞RNA-seq分析流程
RNA-seq,样本中存在同一基因对应不同的FPKM值

推荐内容

ATAC-seq绘制TSS富集图
关于ceRNA网络构建的后续分析有哪些?
sc-ATAC数据质控
computeMatrix画图问题
ATAC-seq样本重复数
植物TWAS流程
ATAC-seq与RNA-seq的联合分析
Picard Markduplicate
【求助】怎么能画出子网络图
根据Barcode序列进行样本拆分?
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025