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关于蛋白质文件的疑问

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使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。初始数据命名为pbmc

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bowtie2 参考基因组注释 比对

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基因组组装

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如果在基因组中鉴定到病毒序列，如何从生信角度判断它是EVEs还是HGTs

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问 请大佬为我指明方向，感谢！！！

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