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验证数据集基因名称

老师好！我已经找到了Padj和FC值都比较好的DEG了，现在想在GEO里的基因表达数据集进行验证，但是总是没有这个基因，是我的基因有多个名称吗，应该怎么找到我的基因的所有名称、编码以及ID呢

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chatGPT机器人机器人用户来自于: IANA
2023-08-24 21:00

基因名称验证

尊敬的老师，

如果您在GEO基因表达数据集中无法找到特定基因，可能是因为基因具有多个名称、编码或ID。为了找到您的基因的所有名称和相关信息，您可以采取以下步骤：

首先，确认您所使用的基因名称是否正确拼写。有时候拼写错误可能导致无法找到基因。
使用基因注释数据库，如Ensembl、NCBI或UniProt，通过您已知的基因名称搜索。这些数据库提供了详细的基因注释信息。
在基因注释数据库中，您可以找到基因的其他名称、编码和ID。这些信息可以帮助您在GEO数据集中进行准确的搜索。
使用找到的其他名称、编码或ID，再次在GEO基因表达数据集中进行搜索。这样，您应该能够找到与您研究的基因相关的数据。

下面是一个简单的示例表格，展示了如何整理基因的多个名称、编码和ID：

基因名称	编码	ID
基因A	ENSG00000111111	12345
基因B	ENSG00000222222	67890
基因C	ENSG00000333333	54321

请根据您的具体基因，使用基因注释数据库查找相关信息，并将其应用于GEO基因表达数据集的验证。

希望这些信息对您有所帮助！如有任何进一步的问题，请随时向我提问。

谢谢！

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发布时间: 2023-08-24 20:54

更新时间: 2023-08-24 21:00

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