该问题已被锁定!
2
关注
3386
浏览

3D基因组里,如何分清compartment、TAD和chromatin loop

查看全部 2 个回答

孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2023-05-23 09:41

这3者的尺度一般意义上是不同的。

compartment主要是Mbp级别的尺度,一般单compartment也要10Mbp这个单位;

TAD主要是染色体内部的一个联系紧密区域,一般认为尺度在几百Kbp ~ Mbp范围;

loop尺度更小,更强调小范围内引起的互作。

关于作者

song 注册会员

这家伙很懒,还没有设置简介

问题动态

发布时间
2023-05-22 21:51
更新时间
2023-05-23 09:41
关注人数
2 人关注

相关问题

基因symbol注释GEO芯片时,如何把mRNA和lncRNA分别标注出来?
大咖们好!如何像群主一样优秀 自带关注
annotatePeak peak基因组注释
如何批量绘制多条折线
在仅有每个样本(有3个repeat)所有转录本的fpkm的情况下,如何利用cuffdiff进行差异基因分析。
【求助】如何确定一种基因ID的类型
ciriRNA表达量如何计算?(更)
无参基因组分析GO富集到了这一步不会做
如何提取可变剪切位点?
用scanpy做单细胞分析,如何去除周期细胞的影响

推荐内容

请问cytoscape是怎么构建网络的?
grep 能不能指定匹配第多少列?
安装R包sf报错
juicer_tools.jar hiccups 运行怎么更改物种?
linux下使用convert出现报错,可能是什么原因?如何解决?
如何根据Datamonkey中FUBAR的结果计算该基因的dn/ds值
转录本坐标转换成基因组坐标
使用Tracking Tumor ImmunoPhenotype(TIP)网站分析TCGA的BLCA_tpm数据
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025