该问题已被锁定!
2
关注
1091
浏览

3D基因组里,如何分清compartment、TAD和chromatin loop

查看全部 2 个回答

孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2023-05-23 09:41

这3者的尺度一般意义上是不同的。

compartment主要是Mbp级别的尺度,一般单compartment也要10Mbp这个单位;

TAD主要是染色体内部的一个联系紧密区域,一般认为尺度在几百Kbp ~ Mbp范围;

loop尺度更小,更强调小范围内引起的互作。

关于作者

song 注册会员

这家伙很懒,还没有设置简介

问题动态

发布时间
2023-05-22 21:51
更新时间
2023-05-23 09:41
关注人数
2 人关注

推荐内容

juicer_tools.jar hiccups 运行怎么更改物种?
L1插入位点的百分比密度分布
关于ceRNA网络构建的后续分析有哪些?
不同样品中寻找特异的OTU
链特异性文库(mRNA/lncRNA/circRNA)如何将RNA类型分开?
pheatmap画图的数据导入问题
转录本坐标转换成基因组坐标
HHblits使用相同的数据库,得出的结果明显差于HHpred网页版的结果。该如何使用HHsuite命令行得到与网页端类似的效果
基因和染色体,lncRNA,mRNA之间的关系是怎样的?
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024