bowtie2 参考基因组注释 比对

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菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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无参基因组分析GO富集到了这一步不会做

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3D基因组里compartment里一般是包含好多TAD的，但这图为什么compartment数量比TAD多这么多呢

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如何根据Datamonkey中FUBAR的结果计算该基因的dn/ds值

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参考基因组添加外源基因序列进行比对

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一般报告基因组某个碱基突变是指正链还是负链

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请问什么是基因组共线性分析？有什么意义？

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怎么寻找某个基因的不同可变剪切形式？

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怎么准确提取某一基因的ATG起始密码子位点

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问 infercnv运行报错

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问 kraken2软件运行时内存分配的问题

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问 做进化树时，有些分支没有bootstrap值，正常吗？为什么？

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问 atac重复样品可视化

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问 pheatmap画图的数据导入问题

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问 关于ceRNA网络构建的后续分析有哪些？

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问 尿代谢组正负离子数据标准化是否可以均用正离子检测出来的肌酐峰

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问 启动子染色质开放性

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