RNA-seq，样本中存在同一基因对应不同的FPKM值

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3D基因组里compartment里一般是包含好多TAD的，但这图为什么compartment数量比TAD多这么多呢

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关于hub基因的问题

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根据GFF和fasta等文件提取某一基因的ATG位点信息，比如具体的位置？

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log2(fold_change)可以用来做热图吗？遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为0时，怎么办？

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使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。初始数据命名为pbmc

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如何通过重测序方法找到大耳朵狗和小耳朵狗的候选基因如何通过重测序方法找到大耳朵狗和小耳朵狗的候选基因，目前已经把测序得到的数据map 到了染色体上，不知道下一步该怎么找候选基因

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WGCNA筛选到感兴趣的模块后，如何找这个模块的hub基因呢？

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细菌基因组分析

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3D基因组里，如何分清compartment、TAD和chromatin loop

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问 pheatmap画图的数据导入问题

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问 HHblits使用相同的数据库，得出的结果明显差于HHpred网页版的结果。该如何使用HHsuite命令行得到与网页端类似的效果

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问 how to speed up following code 

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问 不同样品中寻找特异的OTU

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问 infercnv运行报错

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问 kraken2软件运行时内存分配的问题

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问 做进化树时，有些分支没有bootstrap值，正常吗？为什么？

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问 bcl2fastq2安装问题

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问 关于基因间的相关性分析

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