DiffBind 标准化数据

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已经有不同材料的全基因组二代测序数据，查找是否存在某个已知基因？

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来自不同project的RNA-Seq数据可以直接合并分析吗？

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为什么单端测序的数据解压会出现多个文件？

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最新的cas9蛋白的sgRNA的数据集

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bulk-RNAseq数据集整合

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RNA结合蛋白数据库

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去除批次效应选定靶标细胞群后如何进行亚群分析？

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如何一个数据表中第一列都统一删除三个字母保留数字再输出为一个新表

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如何下载指定文献的原始数据？？

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

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问 基因表达芯片的分类问题

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问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

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问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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