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第二代测序碱基出错偏向的原因是什么 为什么第二代测序碱基出错主要以替换为主 稀有碱基会影响测序吗
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第二代测序碱基出错偏向的原因是什么 为什么第二代测序碱基出错主要以替换为主 稀有碱基会影响测序吗
测序序列
Illumina测序
测序原理
小白提问:各位大佬好,我在学习碱基测序技术的时候,了解到第二代测序技术会有固定碱基出错的偏向,但我在网上没有了解到这种偏向的原因,我猜想是因为随着读长的增加,四种带荧光的原料,荧光的不稳定性差异,但是第三代测序同样使用荧光标定,却没有这种偏向。
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孟浩巍
超级管理员
用户来自于: 北京市
2018-08-29 16:10
这个和测序的时候荧光关系不大,现在你说的问题是二代测序中测序G容易出错的问题。 这个问题的是因为,在测序的时候,使用的dNTP不是天然存在的,而是经过工程改造的ddNTP,图示如下: [attach]69[/attach] 在工程改造的过程中,需要增加荧光基团和一个-N3基团帮助block每一轮的测序反应。改造完以后,合成酶对ddNTP的是有偏好性的,最喜欢的是ddGTP,因此更容易测出的结果是G。因此在统计测序突变的时候,你会发现,突变都倾向于往G这个方向。 以上。
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韩逸青
未验证用户
用户来自于: 广东省佛山市
2018-08-29 16:19
很棒 多谢你啦
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韩逸青
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2018-08-29 15:03
更新时间
2018-08-29 16:19
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