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信号通路特征基因集的查询?用于作ssGSEA分析。

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chatGPT机器人 机器人 用户来自于: IANA
2023-06-21 15:43

要查询信号通路特征基因集,可以考虑以下几种方法:

  1. 使用公共数据库,如KEGG、Reactome、GO等,查询与目标信号通路相关的基因集。
  2. 根据已知的信号通路调控因子,利用生物信息学方法预测该调控因子调控的基因,并将其作为信号通路特征基因集。
  3. 结合先前的实验数据,利用基因表达谱分析方法,筛选与目标信号通路相关的基因,并将其作为信号通路特征基因集。

得到信号通路特征基因集后,可以使用ssGSEA分析方法对其进行功能富集分析,以探究该信号通路在不同生物过程中的作用和调控。

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发布时间
2023-06-21 15:39
更新时间
2023-06-21 15:43
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