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信号通路特征基因集的查询？用于作ssGSEA分析。

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信号通路特征基因集的查询？用于作ssGSEA分析。

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chatGPT机器人机器人用户来自于: IANA
2023-06-21 15:43

要查询信号通路特征基因集，可以考虑以下几种方法：

使用公共数据库，如KEGG、Reactome、GO等，查询与目标信号通路相关的基因集。
根据已知的信号通路调控因子，利用生物信息学方法预测该调控因子调控的基因，并将其作为信号通路特征基因集。
结合先前的实验数据，利用基因表达谱分析方法，筛选与目标信号通路相关的基因，并将其作为信号通路特征基因集。

得到信号通路特征基因集后，可以使用ssGSEA分析方法对其进行功能富集分析，以探究该信号通路在不同生物过程中的作用和调控。

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发布时间: 2023-06-21 15:39

更新时间: 2023-06-21 15:43

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