cafe 结果可视化如何操作？

1450 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

问题：如何筛选WGCNA分析得出的consensus module中的hub基因？

1904 浏览 2 关注 1 回答 1 评论

如何按一个列表对基因型文件进行过滤，剔除不需要的样本？

1885 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

ATAC-seq数据多样本call peak如何合并？

2268 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

【求助】如何确定一种基因ID的类型

2567 浏览 4 关注 2 回答 0 评论

如何知道自己测序的adapter序列？

1932 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

用scanpy做单细胞分析，如何去除周期细胞的影响

2321 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

sgRNA的GC content 是什么意思，该如何计算

1998 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

GAPIT包导出的GWAS结果如何添加新的阈值线？以及GAPIT的结果文件中的nobs、H&B.P.Value、Effect分别是什么意思？

2220 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

x <- x[keep.exprs,, keep.lib.sizes=FALSE] 请问一下这条命令该如何解读呢？

1029 浏览 1 关注 0 回答 2 评论

问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

1474 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

1672 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

1510 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

2034 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

1372 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

1287 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

2041 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

1370 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

2098 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

919 浏览 1 关注 0 回答 0 评论