3D基因组里，如何分清compartment、TAD和chromatin loop

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使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。初始数据命名为pbmc

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菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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​单细胞RNA-seq，如何计算不同cluster之间的相关性

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请问如何查询某基因的详细的Biological Function？

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enhancer结合ATAC-seq进行下游靶基因的寻找策略

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转录本坐标转换成基因组坐标

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【求助】如何确定时期特定表达基因

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问题：如何筛选WGCNA分析得出的consensus module中的hub基因？

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获取所有基因的转录起始位点（TSS）

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问 GEOquery下载GEO数据软件报错

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问 关于几个数据库对GO注释的疑问

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问 请问哪位老铁有ADMIXTURE的软件包吗？原网址UCLA的软件下载界面访问不了

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问 高度杂合变异材料的遗传变异研究采取方法讨论

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问 如何批量下载SRA数据库中的数据？

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问 来自不同project的RNA-Seq数据可以直接合并分析吗？

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问 从bed文件获取注释

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问 L1插入位点的百分比密度分布

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问 riboseq中frame指的是什么，是如何确定的，通过riboseq如何知道一个基因的开放阅读框

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