RNA-seq，样本中存在同一基因对应不同的FPKM值 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

1552: 浏览

RNA-seq，样本中存在同一基因对应不同的FPKM值

RNA_seq

hisat2 stingtie ballgown 组装出来的不同gene id对应同一个symbol，比如样本1中NM_025300对应Mrpl15，FPKM为2，NM_001177658也对应Mrpl15，FPKM为0.6，基因Mrpl15在样本1中的表达不是唯一值，怎么破？

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-24 13:19

这个是有可能的，因为1个gene对应多个转录本，你看到的是每个转录本的FPKM，你看基因的FPKM应该是合并了这些结果之后的表格。

赞同 1 0评论

关于作者

: yongjiu09 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

0: 回答

0: 文章

1: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-23 21:49

更新时间: 2018-09-24 13:19

关注人数: 2 人关注

相关问题

rna-seq数据校正: 1879 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

ATAC-seq与RNA-seq的联合分析: 1326 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

转录组组内样本差异大: 1958 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

转录组数据样本聚类结果不理想: 1907 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

动态库存在但调用报错问题: 1444 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

ATAC-seq数据多样本call peak如何合并？: 2382 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

RNA-seq分析，rlog需要生物学重复才行？有别的Normalization方法吗？: 1556 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

RNA-seq logFC与pvalue: 1377 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

harmony整合样本前需要分别预处理吗？: 2141 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

肿瘤样本的VAF值: 2200 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问【坐标北京】近期准备做一些RNA-seq，想请问一下大家哪些公司比较靠谱？-w-: 1625 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问请问RNA-seq采用poly A(+)策略建库，处理数据时若不去除rRNA会对后续分析有何影响？: 1544 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 RNA-seq分析，rlog需要生物学重复才行？有别的Normalization方法吗？: 1556 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

问公司双端测序的数据R1R2处理: 2215 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问转录组: 2025 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 RNA-seq不同样本多个生物学重复不同处理条件下的如何找差异基因: 1852 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 R语言作火山图问题: 1545 浏览 0 关注 1 回答 0 评论

问用atac-seq数据计算的TSS enrichment score: 2991 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 seurat中如何通过坐标/细胞名删掉细胞: 3531 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 GATK和Samtools联合寻找变异: 2280 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025