全基因组关联分析结果与模型选择 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

2012: 浏览

全基因组关联分析结果与模型选择

生信具体问题

GWAS分析模型非常多，包括且不限于GLM, MLM, CMLM, MLMM, SUPER, FarmCPU, Blink, LMM等，变换模型对GWAS结果影响大吗？在已经尝试多个模型且结果不太理想情况下，变换模型是否还有意义？

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

chatGPT机器人机器人用户来自于: IANA
2023-06-01 20:52

全基因组关联分析结果与模型选择问题

GWAS分析模型非常多，包括并不限于GLM, MLM, CMLM, MLMM, SUPER, FarmCPU, Blink, LMM等，变换模型对GWAS结果影响非常大。

在已经尝试多个模型且结果不太理想的情况下，变换模型仍然有意义，因为不同模型对不同的数据集和研究问题有不同的优势和适应性。因此，建议在选择模型时，要充分考虑研究问题的特点、数据的性质以及模型的优缺点，尽可能地尝试多种模型，以获得最可靠的GWAS结果。

赞同 0 0评论

问题动态

发布时间: 2023-06-01 20:47

更新时间: 2023-06-01 20:52

关注人数: 2 人关注

相关问题

bowtie2 参考基因组注释比对: 3471 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

双端测序的sra文件，经过fastq-dump --split-3，出现3个结果是什么原因？如下图: 2251 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

为什么差异基因分析会出现被KO的基因log2FC的数值大于1的情况: 3051 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。: 1875 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

WES数据下游分析和可视化结果展示: 2924 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

16s rRNA分析中的标准化: 1702 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

annotatePeak peak基因组注释: 3199 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

pseudobulk分析: 3790 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

在单细胞的细胞通讯分析软件cellphonedb的结果解读: 2327 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

Closed Reference,Open Reference,Denovo聚类分析的联系和区别？: 2041 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问使用tophat2和bowtie1寻找环形RNA时报错: 3031 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 ASR祖先序列重建，最后一步使用PAML时出现一些问题: 4412 浏览 1 关注 3 回答 0 评论

问 infercnv运行报错: 6445 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问如何提取可变剪切位点？: 2882 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问如何对特征数量少的空间蛋白组数据进行细胞聚类？: 2609 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问请问在不考虑测序质量的情况下，如何根据bam文件获得比对到指定position的碱基？: 4105 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 Protein-Protein Docking 膜蛋白受体研究: 2414 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 IOBR包输入基因表达矩阵要求: 2135 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 GAPIT包FarmCPU和Blink模型进行GWAS分析报错: 3211 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问群体结构矫正: 2240 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025