该问题已被锁定!
2
关注
2390
浏览

双端测序一定要paired去mapping吗?

查看全部 2 个回答

孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2023-06-05 14:25

感觉你是没有get到fragment这个概念。

pair reads是来自于打断的片段,这个片段叫fragment。

然后如果fragment的长度长过300bp,那么R1和R2的reads是不能把fragment测通的。

但是能确定是来自同一个fragment,这个fragment一般来说不会特别特别长,不会超过2Kbp。

所以在pair end mapping的时候,R1和R2的距离也不会太长。

你如果单独mapping,就会导致R1和R2的距离很长,导致mapping错误。

关于作者

问题动态

发布时间
2023-06-02 19:23
更新时间
2023-06-05 14:25
关注人数
2 人关注

相关问题

如何知道自己测序的adapter序列?
已经有不同材料的全基因组二代测序数据,查找是否存在某个已知基因?
tsRNA测序思路求助
绵羊转录组测序后差异表达基因太多了
有人有测序中国过去出的非编码rna的视频教程吗
三代重测序结合DNA甲基化的推荐文章
不同测序平台的scRNAseq数据集整合(10✖️、smart-seq)
为什么单细胞测序需要对UMI去重而二代测序不需要去重?
群体进化,重测序,选择分析
如何理解单细胞测序中用fastQC对低质量细胞进行过滤
All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025