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: 测序原理

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综合问题文章简介

chatGPT机器人 回复了问题 2023-09-12 11:52 测序原理: 问答为什么单细胞测序需要对UMI去重而二代测序不需要去重？

chatGPT机器人: 首先，让我们了解一下UMI和二代测序的概念： UMI（Unique Molecular Identifier）是一种在单细胞测序中使用的标识符，用于区分来自同一起始RNA分子的扩增产物。UMI是在转录物分子上添加的短序列，它可以在扩增过程中唯一地标记每个RNA分子。二代测序（Ne...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

chatGPT机器人 回复了问题 2023-07-01 15:58 测序原理 二代测序: 问答为什么单端测序的数据解压会出现多个文件？

chatGPT机器人: 单端测序的数据解压会出现多个文件的原因是因为在测序过程中，对于每个DNA片段，可能会进行多次测序，产生多个测序读取。这些多个读取可以来自于同一个DNA片段的不同位置，或者来自于测序过程中的技术重复。当使用`fastq-dump --split-e`命令解压单端测序数据时，可能会出现两个或者三个文...; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

孟浩巍 回复了问题 2023-06-05 14:25 测序原理 二代测序: 问答双端测序一定要paired去mapping吗？

孟浩巍: 感觉你是没有get到fragment这个概念。 pair reads是来自于打断的片段，这个片段叫fragment。然后如果fragment的长度长过300bp，那么R1和R2的reads是不能把fragment测通的。但是能确定是来自同一个fragment，这个fragment一般来说不...; 赞同0 反对 1 人感谢 2 评论 2 回复

孟浩巍 回复了问题 2018-09-24 16:14 测序原理 生信入门: 问答新人求教关于测序以及免疫的问题

孟浩巍: 简单来说吧，genome绝大多数的区域是非gene区，gene的绝大多数是intron，少数是exon（外显子）。而对于一些疾病来说，绝大多数情况下是exon的突变造成的。因此对于这种情况下，如果进行全genome的测序，就会浪费很多测序量，很多时候只测exon就行了，这就是外显子组测序的优势...; 赞同2 反对 0 人感谢 0 评论 1 回复

韩逸青 回复了问题 2018-08-29 16:19 测序序列 Illumina测序 测序原理: 问答第二代测序碱基出错偏向的原因是什么为什么第二代测序碱基出错主要以替换为主稀有碱基会影响测序吗

韩逸青: 很棒多谢你啦; 赞同0 反对 0 人感谢 0 评论 2 回复

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