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知道一批基因的具体位置,如何批量的从基因组中取出基因序列?
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知道一批基因的具体位置,如何批量的从基因组中取出基因序列?
从基因组上获取序列
Chr1 28552 28655 ath-MIR838 255 + Chr1 78931 79030 ath-MIR165a 255 - Chr1 234016 234146 ath-MIR2112 255 - Chr1 1653220 1653624 ath-MIR5640 255 - Chr1 1727262 1727415 ath-MIR5656 255 +如上面信息,知道基因的染色体,和在染色体上的开始结束位置,如何取出基因组上对应位置的碱基序列?
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城管大队哈队长
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用户来自于: 中国
2018-09-19 21:09
制作成bed文件,用bedtools的getfasta即可。 楼主你的文件应该就是bed格式了。改个bed后缀直接用就行。
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restpop
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这家伙很懒,还没有设置简介
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发布时间
2018-09-19 20:27
更新时间
2018-09-19 21:09
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