【求助】如何确定时期特定表达基因

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用GWAS筛选受选择基因，样本数量不够，请问可以用选择消除分析吗

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WGCNA筛选到感兴趣的模块后，如何找这个模块的hub基因呢？

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染色体重叠区域问题

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RNA-seq，样本中存在同一基因对应不同的FPKM值

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基因symbol注释GEO芯片时，如何把mRNA和lncRNA分别标注出来？

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使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。初始数据命名为pbmc

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riboseq中frame指的是什么，是如何确定的，通过riboseq如何知道一个基因的开放阅读框

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已经有不同材料的全基因组二代测序数据，查找是否存在某个已知基因？

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enhancer结合ATAC-seq进行下游靶基因的寻找策略

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问 使用bedtools提取序列时的deyond length问题；bed负值

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问 3D基因组里compartment里一般是包含好多TAD的，但这图为什么compartment数量比TAD多这么多呢

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问 启动子染色质开放性

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问 L1插入位点的百分比密度分布

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问 RNA Seq中什么样的reads是chimeric reads？是不是多数的chimeric reads都是circRNA的？

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问 安装R包sf报错

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问 juicer_tools.jar hiccups 运行怎么更改物种？

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问 如何按一个列表对基因型文件进行过滤，剔除不需要的样本？

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问 不同样品中寻找特异的OTU

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