GEO数据芯片数据基因名转换

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使用seurat包，导出特定cluster的细胞-基因counts矩阵。初始数据命名为pbmc

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如何在差异表达前消除批次效应

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问题：如何筛选WGCNA分析得出的consensus module中的hub基因？

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基因表达芯片的分类问题

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根据基因表达做生存分析OS取出最合适的cutoff

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关于hub基因的问题

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为啥NCBI和ensemble相同版本的基因组注释有这么大的差别？

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关于基因间的相关性分析

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如何根据现有序列找到它们在三代基因组的编号

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问 转录组和代谢组联合分析的方法有那些？

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问 无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因

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问 不同比对软件出的结果能进行比较吗？

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问 如何根据转录组数据得到新转录本？如何验证一个基因的多个转录本？

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问 我测了一批寄生蜂的转录组样品，FPKM值感觉好奇怪，合理吗？

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问 转录组定量结果为0

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问 请问hisat2+stringtie+deseq2的标准流程

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问 二代转录组去除批次效应

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问 WGCNA

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问 原核生物的转录组测序为什么比真核的贵？

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