整合scRNA和scATAC相关问题请教

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stringtie 与DESeq2

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chipseq分析，利用deeptools的computeMatrix reference-point画样本的peak center信号图

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关于ceRNA网络构建的后续分析有哪些？

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sRNA_seq分析

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ATAC-seq不同测序量样本的差异比较

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16s rRNA分析中的标准化

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问一个关于miRNA ID的问题

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sgRNA的GC content 是什么意思，该如何计算

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RNA-seq分析，rlog需要生物学重复才行？有别的Normalization方法吗？

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问 做进化树时，有些分支没有bootstrap值，正常吗？为什么？

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问 3D基因组里，如何分清compartment、TAD和chromatin loop

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问 cellranger使用问题

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问 HHblits使用相同的数据库，得出的结果明显差于HHpred网页版的结果。该如何使用HHsuite命令行得到与网页端类似的效果

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问 关于GO分析的问题

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问 使用bedtools提取序列时的deyond length问题；bed负值

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问 如何根据Datamonkey中FUBAR的结果计算该基因的dn/ds值

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问 logistic回归、异常值

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问 请问下这种格式的R语言内容如何选择最小值

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问 使用lapa进行APA分析

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