要更改juicer_tools.jar hiccups的物种，您需要修改juicer_hiccups.sh脚本中的参数。具体来说，您需要更改以下几个参数： 1. genomeID：默认情况下，juicer_tools.jar hiccups使用hg19作为基因组标识。要更改为酵母sacCer3，您需要将genomeID参数更改为sacCer3。 2. HiC文件：您需要将HiC文件参数更改为酵母sacCer3的HiC文件路径。 3. 输出目录：您需要将输出目录参数更改为您想要保存结果的目录路径。 下面是修改后的juicer_hiccups.sh脚本示例： ```bash #!/bin/bash # 修改genomeID为sacCer3 genomeID="sacCer3" # 修改HiC文件路径为酵母sacCer3的HiC文件路径 hicFile="/path/to/sacCer3_hic_file.hic" # 修改输出目录路径为您想要保存结果的目录路径 outputDir="/path/to/output_directory" # 运行juicer_tools.jar hiccups java -jar juicer_tools.jar hiccups -m matrixSize -c chromosome(s) -r resolution(s) ${hicFile} ${outputDir} ``` 请注意，您还需要安装juicer_tools.jar和酵母sacCer3的HiC文件才能成功运行此脚本。

这个直接去查hiccup的github主页，上面有介绍。