用R画RNA_seq中变化显著的heatmap聚类热图 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

4: 关注

1551: 浏览

用R画RNA_seq中变化显著的heatmap聚类热图

我看了一篇文章https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1674205217302459?via%3Dihub#fig1，想做一个和文章里一样的聚类热图，如下 [attach]36[/attach]，但是我不是很明白它的这个分类的方式，我自己做出来的如下： [attach]35[/attach] 代码为 >data <- log2(cuffdiff_result[,c(7,8)]+1)) >Heatmap(x, name = "expression", km = 5,, show_row_names = FALSE, show_column_names = FALSE) x想知道这样子对不对？有没有什么问题，如果分类之后怎么导出分类数据

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 3 个回答

i_thinking 注册会员用户来自于: 美国
2018-08-24 15:18

文章里的km应该是6.

赞同 0 1评论

关于作者

: jailyn 前台管理员
这家伙很懒，还没有设置简介

7: 回答

0: 文章

5: 问题

问题动态

发布时间: 2018-08-24 12:19

更新时间: 2018-08-24 23:19

关注人数: 4 人关注

相关问题

不同测序平台的scRNAseq数据集整合（10✖️、smart-seq）: 1385 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

在riboseq分析中，如何对没有起始密码子和终止密码子的转录本进行三碱基准确性分析？: 1136 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

想问一个RNA-Seq的流程问题: 1068 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

有人有测序中国过去出的非编码rna的视频教程吗: 853 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

RNA-seq logFC与pvalue: 1010 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

网上下载的DNA sequence 为什么前面和后面有一段N是什么意思？: 1095 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

RNA-seq比对region：exonic/intronic/intergenic 比例异常: 1667 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

用atac-seq数据计算的TSS enrichment score: 2063 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

整合scRNA和scATAC相关问题请教: 1680 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

基因symbol注释GEO芯片时，如何把mRNA和lncRNA分别标注出来？: 1222 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问利用GATK的HaplotypeCaller生成GVCF一直报错怎么回事: 1670 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问求助，安装DESeq2遇到问题: 1023 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 Rstudio怎么打开project: 1547 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问分析CRISPR 高通量筛选数据: 1633 浏览 1 关注 2 回答 0 评论

问 GEOquery下载GEO数据软件报错: 1878 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

问 R进行GO时出现No gene can be mapped....: 1503 浏览 3 关注 3 回答 0 评论

问如何快速将基因名称转换为基因ID(拟南芥）: 1335 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 Closed Reference,Open Reference,Denovo聚类分析的联系和区别？: 1211 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？: 1587 浏览 3 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025