用R画RNA_seq中变化显著的heatmap聚类热图 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

4: 关注

3235: 浏览

用R画RNA_seq中变化显著的heatmap聚类热图

我看了一篇文章https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1674205217302459?via%3Dihub#fig1，想做一个和文章里一样的聚类热图，如下 [attach]36[/attach]，但是我不是很明白它的这个分类的方式，我自己做出来的如下： [attach]35[/attach] 代码为 >data <- log2(cuffdiff_result[,c(7,8)]+1)) >Heatmap(x, name = "expression", km = 5,, show_row_names = FALSE, show_column_names = FALSE) x想知道这样子对不对？有没有什么问题，如果分类之后怎么导出分类数据

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 3 个回答

i_thinking 注册会员用户来自于: 美国
2018-08-24 15:18

文章里的km应该是6.

赞同 0 1评论

关于作者

: jailyn 前台管理员
这家伙很懒，还没有设置简介

7: 回答

0: 文章

5: 问题

问题动态

发布时间: 2018-08-24 12:19

更新时间: 2018-08-24 23:19

关注人数: 4 人关注

相关问题

RNA结合蛋白数据库: 2725 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

RNA.fold_compound(seq)如何改进提升: 2318 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

RNA-seq分析，rlog需要生物学重复才行？有别的Normalization方法吗？: 2020 浏览 1 关注 0 回答 0 评论

ciriRNA表达量如何计算？: 2999 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

chipseq原始文件fastq如何截取DNA长度小于等于260bp进行后续mapping: 2834 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

请问hisat2+stringtie+deseq2的标准流程: 3790 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

用atac-seq数据计算的TSS enrichment score: 4822 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

seqtk的使用技巧，可以处理那些序列问题？: 2165 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

the accessibility of sgRNA binding to the target site是什么意思，有详细解答嘛: 2777 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

单细胞RNA-seq分析流程: 2955 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

推荐内容

问转录组数据样本聚类结果不理想: 2842 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 Closed Reference,Open Reference,Denovo聚类分析的联系和区别？: 2236 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问画heatmap出现错误提示: 1894 浏览 2 关注 1 回答 1 评论

问使用cutadapt去掉adaptor后，fastqc结果的sequence distribution报错: 3132 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 GEOquery下载GEO数据软件报错: 4500 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

问 bowtie2使用报错，求助啦: 2939 浏览 3 关注 3 回答 0 评论

问 linux系统中使用fastqc报错: 3895 浏览 3 关注 3 回答 0 评论

问 Rstudio安装R包时，出现unable to move temporary installation: 3737 浏览 4 关注 3 回答 1 评论

问科研/读博: 2970 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2026