用R画RNA_seq中变化显著的heatmap聚类热图 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

4: 关注

1915: 浏览

用R画RNA_seq中变化显著的heatmap聚类热图

我看了一篇文章https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1674205217302459?via%3Dihub#fig1，想做一个和文章里一样的聚类热图，如下 [attach]36[/attach]，但是我不是很明白它的这个分类的方式，我自己做出来的如下： [attach]35[/attach] 代码为 >data <- log2(cuffdiff_result[,c(7,8)]+1)) >Heatmap(x, name = "expression", km = 5,, show_row_names = FALSE, show_column_names = FALSE) x想知道这样子对不对？有没有什么问题，如果分类之后怎么导出分类数据

好问题 0 评论收藏举报

查看全部 3 个回答

i_thinking 注册会员用户来自于: 美国
2018-08-24 15:18

文章里的km应该是6.

赞同 0 1评论

关于作者

: jailyn 前台管理员
这家伙很懒，还没有设置简介

7: 回答

0: 文章

5: 问题

问题动态

发布时间: 2018-08-24 12:19

更新时间: 2018-08-24 23:19

关注人数: 4 人关注

相关问题

chip-seq 绘制bed 文件区域的 h3k27ac等修饰的信号强度图: 1591 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

关于DESeq2样本聚类的问题: 1313 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

【坐标北京】近期准备做一些RNA-seq，想请问一下大家哪些公司比较靠谱？-w-: 1480 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

关于ceRNA网络构建的后续分析有哪些？: 1197 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

RNA-seq不同样本多个生物学重复不同处理条件下的如何找差异基因: 1637 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

RNA-seq logFC与pvalue: 1189 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

问一个关于miRNA ID的问题: 999 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

deeptools对ChIP-seq可视化中bw文件的选择问题？: 1553 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

Bulk-RNAseq多组数据差异表达基因的筛选: 1912 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

来自不同project的RNA-Seq数据可以直接合并分析吗？: 1794 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问科研/读博: 1780 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 R进行GO时出现No gene can be mapped....: 1732 浏览 3 关注 3 回答 0 评论

问 bowtie2使用报错，求助啦: 1819 浏览 3 关注 3 回答 0 评论

问 ggplot绘图同时存在多个scale_fill_mamual: 2238 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

问如何快速将基因名称转换为基因ID(拟南芥）: 1566 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问关于ggplot2画条图的问题: 1166 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问常用的对测序序列进行聚类分析的软件有什么？及其使用的了什么算法？: 2034 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问画heatmap出现错误提示: 1042 浏览 2 关注 1 回答 1 评论

问 Closed Reference,Open Reference,Denovo聚类分析的联系和区别？: 1389 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 WGCNA中的TOM热图绘制: 1838 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2025