三代测序使用进行gmap比对

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在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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转录组测序问题

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20170804高通量测序视频中05 mapping.sh报错问题

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SMRT三代测序Blasr结果coverage的分析以及可视化？

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grep 能不能指定匹配第多少列？

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FPKM计算问题

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双端测序的sra文件，经过fastq-dump --split-3，出现3个结果是什么原因？如下图

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求重测序不同群体示例数据

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R软件里Bray-Curtis指数计算

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问 来自不同project的RNA-Seq数据可以直接合并分析吗？

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问 人源细胞系ATAC-seq比对率较低，显示支原体污染，如何处理？

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问 为什么单端测序的数据解压会出现多个文件？

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问 如何方便快捷地批量重命名qiime2做出的ASV号？

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问 可否将比对软件的输出文件直接输出到内网的NAS设备中

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问 根据Barcode序列进行样本拆分？

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问 双端测序一定要paired去mapping吗？

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问 两次运行同一个FQ文件产生的bam文件分析结果存在差异

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