stringtie和gffcompare处理转录本的问题 - 做专业的生信问答网站

登录

该问题已被锁定！

2: 关注

695: 浏览

stringtie和gffcompare处理转录本的问题

官网说stringtie merge是对多个样本的转录本合并成一个非冗余的转录本。在做lncrna鉴定的时候，我到底是先合并再用gffcompare比较，还是先比较再合并。结果会不会不同

好问题 0 评论收藏举报

1 回答

孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2018-09-10 09:38

如果是鉴定新的lncRNA，应该是先compare再merge吧。

赞同 0 0评论

关于作者

: dk_bioinfo 注册会员
这家伙很懒，还没有设置简介

0: 回答

0: 文章

5: 问题

问题动态

发布时间: 2018-09-09 17:52

更新时间: 2018-09-10 09:38

关注人数: 2 人关注

相关问题

转录组: 1202 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

单细胞转录因子: 776 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

stringtie 与DESeq2: 362 浏览 1 关注 0 回答 1 评论

转录组测序问题: 902 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

请教一个问题，一个转录因子TF只会调控位于同一条链的基因，还是有可能调控反义链的基因？: 891 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

harmony整合样本前需要分别预处理吗？: 917 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

xpclr的XPCLR_score的inf值应该怎么处理: 841 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

非已知转录因子预测: 642 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

在仅有每个样本(有3个repeat)所有转录本的fpkm的情况下，如何利用cuffdiff进行差异基因分析。: 1101 浏览 4 关注 3 回答 0 评论

请问hemmer是否可以使用转录组搜索HMM库？: 658 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

推荐内容

问 lnc筛选: 552 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 Stringtie报错: 719 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

All Rights Reserved Powered BY WeCenter V4.1.0 © 2024