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dk_bioinfo 在 2018-09-18 16:49 发起了提问 基因 转录本 lnc筛选: 问答 lnc筛选

孟浩巍: 一般情况下是都保留。; 关注问题 2  0  0 评论

dk_bioinfo 在 2018-09-14 10:34 发起了提问 featurecounts FPKM: 问答 FPKM计算问题

孟浩巍: 计算FPKM建议用cufflink（单样本）或者 cuffnorm（多样本）; 关注问题 2  0  0 评论

dk_bioinfo 在 2018-09-09 17:52 发起了提问 新基因鉴定 转录本: 问答 stringtie和gffcompare处理转录本的问题

孟浩巍: 如果是鉴定新的lncRNA，应该是先compare再merge吧。; 关注问题 2  0  0 评论

dk_bioinfo 在 2018-09-02 08:33 发起了提问 比对统计 sam文件 hisat2 转录组比对: 问答 reads比对的统计

minus_yao: 可以用RseQC 软件中的脚本，是一个python包，有geneBody_coverage2.py, read_distribution.py, RPKM_saturation.py进行测序结果统计分析; 关注问题 2  2  0 评论

dk_bioinfo 在 2018-08-31 17:35 发起了提问 htseq: 问答 htseq使用出现故障

孟浩巍: 提供一个解决问题的思路： 1. 确定你htseq调用的是哪个python，一般情况下是默认的python，所以直接用which python来确定； 2. 直接在终端运行python，之后import pysam，能成功以后即可。 3. 我猜测很可能是htseq调用的python和你用pip或者...; 关注问题 2  0  0 评论

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