关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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chromosome名称转换 的批量处理

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安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

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在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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RNA-seq不同样本多个生物学重复不同处理条件下的如何找差异基因

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多个处理组的RNAseq分析中关于counts表格合并的问题

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Chip-seq bam文件的处理

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如何针对affy表达谱芯片计算结果分析不同样本之间是否表达差异

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芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

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