关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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harmony整合样本前需要分别预处理吗？

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求助一个shell脚本问题，如何批量处理下面这种情况？

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表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

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如何处理fastqc报告中duplication level报错的问题

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公司双端测序的数据R1R2处理

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stringtie和gffcompare处理转录本的问题

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使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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人源细胞系ATAC-seq比对率较低，显示支原体污染，如何处理？

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