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juicer_tools.jar hiccups 运行怎么更改物种？

生信问题

juicer进行下游分析时，arrowhead和hiccups默认genomeID=hg19,现在分析的物种是酵母sacCer3，如何来更改？

使用：hiccups [-m matrixSize] [-c chromosome(s)] [-r resolution(s)]
<HiC file> <outputDirectory>

hiccups代码：https://github.com/aidenlab/juicer/blob/main/CPU/common/juicer_hiccups.sh

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孟浩巍超级管理员用户来自于: 北京市
2023-08-15 17:10

这个直接去查hiccup的github主页，上面有介绍。

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问题动态

发布时间: 2023-08-05 11:35

更新时间: 2023-08-15 17:10

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