人源细胞系ATAC-seq比对率较低，显示支原体污染，如何处理？

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riboseq中frame指的是什么，是如何确定的，通过riboseq如何知道一个基因的开放阅读框

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基因symbol注释GEO芯片时，如何把mRNA和lncRNA分别标注出来？

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通过富集得到了一些信号通路，我想看看这些通路里哪些是和癌症相关的，如何实现呢？

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perl的如何进行读取和循环的

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请问在不考虑测序质量的情况下，如何根据bam文件获得比对到指定position的碱基？

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菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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如何使用wget命令下载“清华云盘”内的文件

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ubuntu 14.04 server版安装软件 biocLite("highthroughputassays")，出现如下报错如何解决呢？

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请问有谁知道这张图是如何绘制的吗，在NCBI的Conserved Domians模块没找到可以直接导出的地方

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

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问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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