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在做RNA Velocity的时候增殖细胞群总是起点

单细胞RNA_seq

我们一般做单细胞分析的时候会用seurat自带的去除细胞周期的功能，可是保不了还是会有一小群高表达TOP2A，MKI67等marker的细胞群，我们将其定义为cell cycle，就不去研究它了，但是在做RNA velocity的时候，这群细胞确实整个发育的起点，可能是因为这群细胞在高度增殖吧，但是这群又不能当成一个关键的起点群去研究，这种问题该如何处理呢？

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前台管理员用户来自于: 北京市
2023-06-08 17:00

增殖的细胞一般不会作为起点，增殖的细胞一般是处于过渡态。

可以尝试在计算velocity的时候，去除增殖相关的基因。

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发布时间: 2023-06-08 16:28

更新时间: 2023-06-08 17:00

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