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在做普通转录组的跨物种分析时,,用什么标准化方法对counts进行矫正好呢?目前有用过tmm矫正,最大最小化 ,Z分都试过,效果都不行,,同时用edger做差异分析时,两物种差异基因太多了,有近35%,中间肯定是有问题的,但是应该从哪方面入手去解决这个问题呢?
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能详细描述一下,什么叫跨物种进行差异分析吗?
生信小白
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