snippy calling 微生物snp

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菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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RNA-seq分析，rlog需要生物学重复才行？有别的Normalization方法吗？

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测了实验组与对照组的mRNA与miRNA的转录组，miRNA-mRNA互作分析网络怎么处理呢？

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获取所有基因的转录起始位点（TSS）

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请教一个问题，一个转录因子TF只会调控位于同一条链的基因，还是有可能调控反义链的基因？

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RNA-seq不同样本多个生物学重复不同处理条件下的如何找差异基因

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请问无参转录组的GO分析如何进行

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我测了一批寄生蜂的转录组样品，FPKM值感觉好奇怪，合理吗？

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转录本坐标转换成基因组坐标

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问 WGCNA

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问 synapser无法加载

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问 二代转录组去除批次效应

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问 请教一个问题，一个转录因子TF只会调控位于同一条链的基因，还是有可能调控反义链的基因？

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问 菌侵染植物的转录组分析中，若菌的一个基因在当前时间没有引起植物基因的变化，过了三个小时后才引起植物基因的变化，如何分析这种现象或如何将这一类基因关联起来，有没有类似的文献推荐？

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问 我测了一批寄生蜂的转录组样品，FPKM值感觉好奇怪，合理吗？

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问 log2(fold_change)可以用来做热图吗？遇到想要表达的目的基因log2(fold_change)值为0时，怎么办？

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问 转录组和代谢组联合分析的方法有那些？

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问 如何根据转录组数据得到新转录本？如何验证一个基因的多个转录本？

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问 几个酶有许多共同基因，这些酶产物之间存在什么关系

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