blastp后，我想提取score的序列，请问使用python应该怎么写这个脚本

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请问一下，R语言环境下，如何在dataframe数据中添加一个key列呢？具体描述见正文

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x <- x[keep.exprs,, keep.lib.sizes=FALSE] 请问一下这条命令该如何解读呢？

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请问在不考虑测序质量的情况下，如何根据bam文件获得比对到指定position的碱基？

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请问一下，使用conda install deeptools之后，出现如下报错，如何解决呢？

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ChIP-Seq deeptools热图信号比较为啥一般不做统计检验比较？

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芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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我想从蠕虫库寄生虫 (wormbase.org)上下载全部的fa文件，请问怎么样才能批量的下载，同时下载的速度可以稍微快一点

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奇异值分解在处理芯片数据时的意义是什么？

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请问RNA-seq采用poly A(+)策略建库，处理数据时若不去除rRNA会对后续分析有何影响？

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问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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问 基因表达芯片的分类问题

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问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

1948 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

2120 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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