奇异值分解在处理芯片数据时的意义是什么？

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请问hemmer是否可以使用转录组搜索HMM库？

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用GWAS筛选受选择基因，样本数量不够，请问可以用选择消除分析吗

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基因表达芯片的分类问题

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请问大家都是用什么做KEGG功能注释的呢

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请问什么是基因组共线性分析？有什么意义？

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chipseq中一共一般有多少峰，可以认为实验是比较靠谱的呢

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请问在不考虑测序质量的情况下，如何根据bam文件获得比对到指定position的碱基？

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请问一下，使用conda install deeptools之后，出现如下报错，如何解决呢？

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请问如何使用R语言绘制散点图

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

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问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

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问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

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问 基因表达芯片的分类问题

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问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

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问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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