当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

2736 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

ChIP-seq的bigwig文件可以使用rpkm>1过滤掉一些弱的信号吗？

2823 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

如何使用wget命令下载“清华云盘”内的文件

5320 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

使用fastp软件对fastq文件质控的问题

3476 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

3D基因组里compartment里一般是包含好多TAD的，但这图为什么compartment数量比TAD多这么多呢

2788 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

使用Tracking Tumor ImmunoPhenotype(TIP)网站分析TCGA的BLCA_tpm数据

2658 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

使用bwa index 时遇到问题

2981 浏览 2 关注 1 回答 2 评论

cellranger使用问题

3458 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

使用Trimmomatic切除接头后做FASTQC

2605 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

trimmomatric使用报错

2921 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

1948 浏览 1 关注 1 回答 0 评论

问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

2120 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

3161 浏览 2 关注 2 回答 0 评论

问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

2919 浏览 2 关注 3 回答 0 评论

问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

2006 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

3053 浏览 5 关注 3 回答 0 评论

问 基因表达芯片的分类问题

2488 浏览 3 关注 2 回答 0 评论

问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

2736 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

1948 浏览 2 关注 1 回答 0 评论

问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

2168 浏览 2 关注 1 回答 0 评论