使用bedtools提取序列时的deyond length问题；bed负值

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ChIP-seq的bigwig文件可以使用rpkm>1过滤掉一些弱的信号吗？

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关于cufflinks中cuffdiff的使用问题。

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为什么我的R count用不了呢？

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如何使用wget命令下载“清华云盘”内的文件

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使用bwa index 时遇到问题

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blastp后，我想提取score的序列，请问使用python应该怎么写这个脚本

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请问如何使用R语言绘制散点图

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seqtk的使用技巧，可以处理那些序列问题？

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htseq使用出现故障

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问 小麦660K芯片里，参考碱基那一列的A/C，哪个才是参考基因组的碱基？

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问 关于affy芯片Affymetrix Human Genome U133 Plus 2.0 Array的注释文件，为何GEO、affy官方与Bioconductor的注释数据有差别？

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问 如何判断一篇CHIPseq的文章用的是hg19还是hg38

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问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

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问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

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问 Affy包中的MAplot函数的作用是什么？画出的MAplot图如何解读？为何要进行MAplot检查？

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问 基因表达芯片的分类问题

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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