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如何理解单细胞测序中用fastQC对低质量细胞进行过滤

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孟浩巍 超级管理员 用户来自于: 北京市
2018-09-05 09:19
是这样滴,FastQC只能生成质量报告,不能够设置参数进行处理。 你这里面提到的mapping ratio,mapping gene ratio等等都需要自己再后续计算,和FastQC关系不大。 我建议你看一下我们之前zhihu专栏里写的关于FastQC的报告解读。   另外,单细胞现在有各种完整的工具包去做这些事情,不用担心,现在都已经流程化了。

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发布时间
2018-09-05 09:13
更新时间
2018-09-05 09:19
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