如何使用wget命令下载“清华云盘”内的文件

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RNA-seq不同样本多个生物学重复不同处理条件下的如何找差异基因

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多种DL based的label transfer自动注释细胞类型,降维clustering两者不太匹配. 如何进行下一步的paga analysis呢?

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GAPIT包导出的GWAS结果如何添加新的阈值线？以及GAPIT的结果文件中的nobs、H&B.P.Value、Effect分别是什么意思？

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x <- x[keep.exprs,, keep.lib.sizes=FALSE] 请问一下这条命令该如何解读呢？

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如何根据Datamonkey中FUBAR的结果计算该基因的dn/ds值

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进行转录组数据分析时，进行cuffdiff后的输出文件gene_exp.diff中，一个基因出现了两个不同的表达量数据，应该如何处理？

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【求助】如何判断一个基因是否存在表观修饰的位点？

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链特异性文库（mRNA/lncRNA/circRNA）如何将RNA类型分开？

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无对照的转录组数据如何寻找差异表达基因

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问 芯片数据去除批次效应一般用什么软件 如何操作？

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问 表达谱芯片的类型及每种类型能够测定的基因数量如何查询？有没有网站进行过总结？

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问 芯片数据的批次效应 对 差异表达基因的计算结果 影响大不大？

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问 安捷伦（Agilent）的数据处理软件Feature Extraction Software的默认的数据标准化的算法是什么？最后得到的值是否做了log2处理？是否是RMA或者MASS的一种？

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问 当LIMMA计算计算结果中的调整P值都大于0.05时，可否使用p值<0.05+fc>2来筛选差异表达基因？

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问 基因表达芯片的分类问题

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问 求助 limma计算DEG最后结果中的调整p值没有小于0.01的怎么办。。。

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问 请问芯片数据分析的一般流程及涉及的常用算法？

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问 使用MAS5.0处理过的芯片数据，能不能直接取对数后用limma包找差异表达基因，为什么不能？

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问 在很多分析表达谱芯片的教程中，使用limma 包寻找差异表达基因，都是先找到差异表达探针，再把探针注释为基因id，为何不先进行注释再计算差异表达呢？这两种方法有什么区别呢？

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